从人体生理与解剖来看，孕育胎儿的子宫腔，与阴道仅以子宫颈相隔，子宫颈平时紧闭，可以有效地防止细菌侵入，以保证孕期胎儿有一个理想的生长环境。人工流产时，必须先经过金属器械扩开紧闭的宫颈后，带负压的吸引管才能进入官腔内将植入子宫内膜的幼小的胚芽吸出。
由此可见，即使操作本身不失误，也可能引起子宫颈口松弛及内膜创伤。多次人工流产或操作不慎就更可能损伤宫颈，以致子宫颈肌肉及纤维断裂而形成疤痕，常会引发难以治愈的习惯性流产。多次人工流产可因扩张过度为细菌入侵大开方便之门，轻者引起子宫内膜炎或输卵管炎，重者可造成盆腔炎及不孕症。
即使孕卵着床也会因子宫内膜因多次吸刮遭受损伤而影响胎盘的种植和发生胎盘血液循环障碍，致胎儿缺氧而生长迟缓，使早产儿及新生儿死亡率升高;其次，多次人流容易损伤子宫内膜，因吸刮时最容易损伤子宫内膜基底层组织，所以导致子宫穿孔的也不乏其例。在子宫内膜与功能层基底层组织之间的正常组织被破坏以后，子宫内膜很容易向基底层或肌层组织内生长，形成子宫肌腺症或腺肌瘤，导致月经过多、不孕、腹痛等症。
再则，多次人流有形成自然流产的危险。因反复流产给妇女的神经内分泌和生殖机能带来一定的影响，尤其是对未产妇可增加妊娠早期、中期的自然流产率。还增加异位妊娠、前置胎盘和产后出血的发病率。多次做人工流产手术，不仅容易诱发生殖系统疾病，而且对乳腺有潜在的危害，影响日后哺乳。
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